Illumina MiSeq高通量测序降解黑龙江绥化地区玉米秸秆细菌菌群的研究

• 作者: 姜喆 孙宏文 徐丽萍 葛英亮
• 来源期刊: 食品工业科技
• 学科: 工学
• 关键词: Illumina MiSeq测序 玉米秸秆 细菌菌群 降解
• 年，卷（期）: 2018,（23）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 105-110
• 页数: 6页
• 分类号: TS201
• 语种: 中文
• DOI: 10.13386/j.issn1002-0306.2018.23.019

摘要

以研究黑龙江绥化地区农产废弃物玉米秸秆细菌降解菌群为目的,采用Illumina MiSeq微生物多样性测序的方法,对2015～2017年玉米秸秆的菌群多样性进行测序.采用生物信息学的方法对低温自然降解秸秆细菌群落中主要降解菌进行分析,并筛选了2015～2017年玉米秸秆中两株丰度最高的纤维素降解细菌,经多次分离纯化并结合刚果红染色法验证其低温降解纤维素的功能.结果表明,测序获得61564385 bp,质控后共141219条16S rDNA序列,Silva数据库比对到14门、29纲、70目、136科、282属.其中假单胞菌属(Pseudomonas)、根瘤菌属(Rhizobium)、德沃西亚菌属(Devosia)、黄杆菌属(Flavobacterium)、微杆菌属(Microbacterium)和链霉菌属(Streptomyces)等是降解秸秆的主要细菌菌株,即该地区玉米秸秆细菌菌群多样性丰富,且研究筛选出的两株细菌具有纤维素降解能力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛英亮	哈尔滨学院食品工程学院	22	119	6.0	9.0
7	徐丽萍	哈尔滨商业大学食品工程学院	54	376	9.0	17.0
8	孙宏文	哈尔滨学院食品工程学院	15	48	4.0	5.0
12	姜喆	哈尔滨商业大学食品工程学院	3	5	2.0	2.0