3个生长温度的家蝇幼虫转录组和表达谱分析

• 作者: 卢穗华 柯德森 黄靖怡
• 来源期刊: 广东化工
• 学科: 工学
• 关键词: 家蝇幼虫 转录组 数字基因表达谱
• 年，卷（期）: 2018,（9）
• 所属期刊栏目: 试验与研究
• 页码范围: 20-22
• 页数: 3页
• 分类号: T384.2
• 字数: 2820字
• 语种: 中文

摘要

目的:通过3个不同生长温度的家蝇幼虫表达谱差异分析,为进一步探究温度引起的家蝇幼虫转录组变化提供实验数据.方法:提取3个生长温度(18℃、28℃、38℃)4龄期家蝇幼虫总RNA,反转录成cDNA,进行Illumina测序、de novo组装及生物信息学分析.结果:对3个不同生长温度的家蝇幼虫转录组测序组装共得到43,570个Unigene,分别将18℃和38℃培养的家蝇幼虫转录组与28℃培养的家蝇幼虫转录组进行比较,筛选到10,863个和11,606个差异表达基因,其中共同上调的差异表达基因有1,994个,共同下调的差异表达基因有3,640个.对差异基因进一步GO功能显著性富集分析和KEGG通路分析显示,这些差异表达基因主要细胞、细胞组分、代谢过程有关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柯德森	广州大学生命科学院	48	106	5.0	8.0
2	卢穗华	广州大学生命科学院	2	1	1.0	1.0
3	黄靖怡	广州大学生命科学院	4	1	1.0	1.0