阿尔茨海默病患者外周血和脑组织GPI基因表达观察及其功能的生物信息学分析

• 作者: 刘明妍 宫世强 杜可 钟欣 马国维 魏敏杰
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 阿尔茨海默病 磷酸葡萄糖异构酶 生物信息学分析 能量代谢
• 年，卷（期）: 2018,（48）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: R742
• 字数: 3215字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.48.001

摘要

目的 基于GEO芯片技术观察阿尔茨海默病(AD)患者外周血和脑组织磷酸葡萄糖异构酶(GPI)基因的表达情况,分析GPI基因的功能及其与AD发病的关系.方法 获取健康老年人大脑额叶皮质样本18例份、颞叶皮质样本19例份、海马样本19例份、外周血样本14例份及AD患者大脑额叶皮质样本15例份、颞叶皮质样本10例份、海马样本29例份、外周血样本14例份.利用GEO数据库筛选适用于AD的相关芯片,检测健康老年人及AD患者外周血、脑组织样本GPI基因.借助蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图筛选GPI的相关基因;通过基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,筛选GPI基因可能参与并主要影响的生物学功能或通路.结果 外周血芯片分析结果显示,健康老年人中,女性外周血GPI基因表达量低于男性,且低于男性AD患者(P均＜0.05);相同性别人群中,AD患者外周血GPI基因表达量低于健康老年人(P均＜0.05).脑组织芯片分析结果显示,AD患者海马组织GPI基因表达明显下调,低于额叶、颞叶皮质(P均＜0.05);GPI基因表达量随AD病情加重而持续减少(P均＜0.05).通过PPI网络图,共筛选出10个与GPI高度相关基因,分别为PKM、TPI1、PFKL、PKLR、PGM1、PFKP、ENO3、PFKM、H6PD、TKT.GO分析及KEGG功能富集分析结果显示,GPI基因与其相关的10个基因在功能富集上与糖酵解、合成、分解、代谢等能量代谢过程高度相关.结论 AD患者外周血及海马组织GPI基因表达下调,随AD病情加重,其表达持续减少;GPI基因与其相关基因可能参与AD患者海马脑区能量代谢的功能调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	魏敏杰	中国医科大学药学院	132	692	13.0	19.0
2	刘明妍	中国医科大学药学院	22	69	5.0	7.0
3	杜可	中国医科大学药学院	7	13	3.0	3.0
4	钟欣	中国医科大学药学院	7	15	3.0	3.0
5	马国维	中国医科大学药学院	1	0	0.0	0.0
6	宫世强	中国医科大学药学院	2	0	0.0	0.0