基于基因组学分析嗜热链球菌KLDS SM的蛋白质水解系统和氨基酸合成途径

• 作者: 丁秀云 刘飞 李娜 李柏良 蒙月月 赵莉 霍贵成 靳妲
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 医学
• 关键词: 嗜热链球菌 基因组 生物信息分析 蛋白质水解 氨基酸合成
• 年，卷（期）: 2018,（18）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 120-126
• 页数: 7页
• 分类号: R151.1
• 字数: 5674字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-201818019

摘要

为从遗传水平上探究嗜热链球菌KLDS SM蛋白质水解和氨基酸合成的能力,首先基于Illumina Hiseq 2500与Pacbio RSII测序平台对嗜热链球菌KLDS SM进行全基因组测序并绘制基因组图谱;随后从胞外蛋白酶、转运系统、胞内肽酶以及氨基酸合成等方面所涉及的基因进行生物信息学分析;最后对15株已完成全基因组测序的嗜热链球菌的氨基酸合成能力进行比较基因组学研究.结果表明:菌株KLDS SM的基因组由一个1856787 bp环状染色体组成,GC含量为39.08％,含有1732个蛋白质编码基因;菌株KLDS SM具有完整的蛋白水解系统和8种氨基酸的合成能力;15株嗜热链球菌在氨基酸合成方面上相对保守,仅在组氨酸合成途径存在较大的差异.本研究为该菌株氮代谢能力的挖掘提供了理论依据,并在将其开发为发酵剂方面上具有一定指导意义.