陆地棉GhWOX4转录因子的克隆与生物信息学分析

• 作者: 吕有军 张永山 杨卫军 赵兰杰
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 WOX4基因 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 28-32
• 页数: 5页
• 分类号: S562.01
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2018.05.007

摘要

采用反转录PCR(简称RT-PCR)技术从陆地棉(Gossypium hirsutum L.)中克隆获得1个WOX基因,命名为GhWOX4(NCBI 登录号:KX900572).序列分析显示,GhWOX4的开放阅读框为657 bp,编码含218个氨基酸残基的蛋白,具有典型高度保守的同源异型HD结构域,属于WOX转录因子家族.生物信息学分析表明,该基因蛋白相对分子量为25.19 ku,等电点为10.04,为不稳定蛋白.二级结构以无规则卷曲为蛋白最大量的结构元件.与其他植物同源基因序列比对显示,其同源区域主要集中在同源异型HD结构域.系统进化树分析表明,GhWOX4属于Ⅰ类家族成员,与陆地棉Gh_D01G1055、拟南芥AtWOX4和可可树TcWOX4等亲缘关系最近,处于同一个进化分支,推测其可能与之前报道的拟南芥WOX基因类似,参与植物维管束及花器官发育.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨卫军		23	53	4.0	6.0
2	张永山	中国农业科学院棉花研究所	15	102	6.0	9.0
3	吕有军		18	244	7.0	15.0
12	赵兰杰	中国农业科学院棉花研究所	3	10	2.0	3.0