人源性IGFBP3的生物信息学分析

• 作者: 周大杰 张玉洁 郏雁飞 陈晓玮 马晓丽
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 生物学
• 关键词: 胰岛素样生长因子结合蛋白3 生物信息学 分子结构 生物学功能 基质金属蛋白酶2
• 年，卷（期）: 2018,（28）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 20-23
• 页数: 4页
• 分类号: Q74
• 字数: 3004字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2018.28.005

摘要

目的 采用生物信息学方法 预测人源性胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP3)的分子结构和生物学功能.方法从美国生物信息中心获取人源性IGFBP3基因mRNA和蛋白氨基酸序列,利用ORF Finder在线工具分析IGFBP3蛋白开放阅读框,ProtParam预测IGFBP3蛋白的理化性质,Predict-Protein和SOPMA工具预测IGFBP3蛋白的二级结构,SWISS-MODEL预测IGFBP3蛋白的三级结构,SignalP4.1 Server和NLStradamus工具预测IGFBP3蛋白的信号肽和核定位信号,TMHMM软件包分析IGFBP3蛋白的跨膜区,BLAST工具预测IGFBP3蛋白的结构域,String软件预测与IGFBP3蛋白相互作用的蛋白,Gene Ontology Consortium预测IGFBP3蛋白的生物学功能.结果 IGFBP3属于不稳定亲水性分泌蛋白,二级结构主要为环状结构和螺旋结构,无跨膜区,包含5个保守结构域,能在细胞核中发挥生物学效应,与MMP2等多种蛋白作用紧密.IGFBP3可参与细胞凋亡、细胞增殖负调控、蛋白质磷酸化负调控、信号转导负调控、胰岛素样生长因子受体信号通路调控等生物学功能.结论 人源性IGFBP3是肿瘤发生的负性调控因子,可介导MMP2及其下游信号通路,参与调控肿瘤的发生、发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郏雁飞		19	56	5.0	5.0
2	马晓丽		18	65	5.0	7.0
3	张玉洁		4	1	1.0	1.0
4	周大杰		1	1	1.0	1.0
5	陈晓玮		1	1	1.0	1.0