狐狸PMEL基因密码子使用特性分析

• 作者: 李丽莎 李祥龙 郑晓宁
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 狐狸 PMEL基因 密码子偏好性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 31-36
• 页数: 6页
• 分类号: Q755
• 字数: 3877字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15889/j.issn.1002-1302.2018.08.007

摘要

前黑素小体蛋白(PMEL)对狐狸毛色中黑色素的合成和沉积过程有重要的调控作用.利用CodonW软件和系统聚类分析法等分析狐狸及14种哺乳动物PMEL基因的密码子偏性,为研究PMEL基因蛋白质表达机制提供理论依据.结果表明,狐狸PMEL基因偏好使用的密码子有34个,以G/C结尾密码子的同义密码子相对使用度明显偏高.该基因编码亮氨酸、缬氨酸的2个最优密码子分别为CTG、GTG.狐狸PMEL基因在密码子偏好的使用上与家猫、猎豹相似,但与同源性极高的家犬不同.基于同义密码子相对使用度的系统聚类分析结果表明,家猫和狐狸均为一类,在密码子使用上最为相似.为研究PMEL基因的表达机制及目的蛋白表达水平的提高提供了理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李祥龙		65	311	9.0	14.0
5	李丽莎		14	71	5.0	7.0
6	郑晓宁		4	16	2.0	4.0