生物土壤结皮土生对齿藓转录组SSR位点分析

• 作者: 玉苏甫江 赵浩然 陈莉 黄琳淞
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 土生对齿藓 转录组 SSR
• 年，卷（期）: 2018,（11）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 78-80
• 页数: 3页
• 分类号: S188
• 字数: 2178字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2018.11.026

摘要

[目的]分析生物土壤结皮土生对齿藓转录组SSR位点.[方法]以生物土壤结皮土生对齿藓为材料,分析土生对齿藓转录组数据,开发土生对齿藓SSR分子标记技术.[结果]通过MISA软件对土生对齿藓高通量测序获得的73084条unigenes进行SSR筛选.从搜索序列中发现4103个符合条件的SSRs,分布在3420条unigenes上,出现频率为5.62%.三核苷酸和二核苷酸为主要重复类型,分别占SSR总数的47.9%和26.1%,AGC/CTG(31.9%)和AG/CT(75.5%)分别是其主要重复基元.69.0%的基序长度为12 ~20 bp.[结论]土生对齿藓转录组SSR位点出现频率高、类型丰富、多态性潜能大,为土生对齿藓分子生物学机制研究等方面提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈莉	西北民族大学生命科学与工程学院	20	80	6.0	8.0
2	赵浩然	西北民族大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
3	黄琳淞	西北民族大学生命科学与工程学院	1	0	0.0	0.0
4	玉苏甫江	西北民族大学生命科学与工程学院	5	45	3.0	5.0