沙田柚生长素响应基因SAUR的鉴定及序列分析

• 作者: 徐媛 李惠敏 李璐璐 秦新民 陈玉梅 陈锦玲
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 沙田柚 自交不亲和 SAUR基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2018,（22）
• 所属期刊栏目: 动物科学· 生物技术
• 页码范围: 81-84
• 页数: 4页
• 分类号: S188
• 字数: 2993字
• 语种: 中文

摘要

[目的]研究沙田柚生长素响应基因SAUR基因编码的蛋白质序列所包含的生物信息学.[方法]以沙田柚自交和异交花柱为材料,通过高通量测序技术进行转录组测序,在差异表达基因中鉴定出SAUR基因.[结果]该基因全长857 bp(登录号为MH281940),开放阅读框(ORF)为381 bp,编码126个氨基酸,编码的蛋白质理论等电点为5.76,相对分子质量为13.74 kD,含有1个与Auxin_inducible superfamily蛋白相同的保守结构域.沙田柚SAUR基因在自交1～3 d花柱中的表达量(RPKM)分别为8.42、56.02、53.45;而在异交1～3 d花柱中的表达量分别为11.98、36.74、8.53.氨基酸序列分析表明,该基因编码的氨基酸与克莱门柚和甜橙SAUR基因编码的氨基酸的同源性分别为100％、99％.系统进化树显示,沙田柚SAUR基因与克莱门柚和甜橙的亲缘关系很近,属同一进化分支.[结论]研究结果可为今后深入研究沙田柚自交不亲和机理提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
3	徐媛	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
4	陈玉梅	广西师范大学生命科学学院	9	10	1.0	3.0
5	陈锦玲	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
6	李璐璐	广西师范大学生命科学学院	9	3	1.0	1.0