野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性研究

• 作者: 兰阿峰 杨曼 邓百万 郭素芬
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 野生秦岭羚牛 瘤胃 产甲烷古菌 分子多样性
• 年，卷（期）: 2018,（8）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 88-91
• 页数: 4页
• 分类号: S852.6|Q939
• 字数: 3235字
• 语种: 中文

摘要

[目的]了解野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌的组成及其多样性.[方法]提取野生秦岭羚牛瘤胃内容物总DNA,选用产甲烷菌特异性引物Met86F和Met1340R,对总DNA进行16S rRNA特异性扩增,构建秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌16S rRNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树.[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的105个阳性克隆归为14个不同的可操作分类单元(OTUs).系统发育分析表明,这些克隆序列均位于广域古菌门(Euryarchaeota),隶属甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae,65.71%)、Methanomassiliicoccus(29.52%)和 Methanosarci-naceae(4.76%)3个科.其中有57个序列与可培养菌相似度在97%以上,分属于Methanobrevibacter millerae、Methanobrevibacter olleyae 和Methanobrevibacter thaueri.其余48个序列与未培养菌相似度较高,占11个OTUs.[结论]野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性比较丰富,且可能存在新的分类单元.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓百万	陕西理工学院生物科学与工程学院	111	874	17.0	22.0
3	兰阿峰	陕西理工学院生物科学与工程学院	18	45	5.0	6.0
7	郭素芬	陕西理工学院生物科学与工程学院	16	27	4.0	5.0
8	杨曼	陕西理工学院生物科学与工程学院	4	16	2.0	4.0