2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性分析

• 作者: 任凤山 吴新颖 杨立英 王咏梅 王鹏飞 苏玲 蒋锡龙 高欢欢
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 果蝇 葡萄 线粒体 密码子偏好性 NADH dehydrogenase subunit RSCU
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术
• 页码范围: 96-101
• 页数: 6页
• 分类号: S188
• 字数: 5160字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2018.01.029

摘要

[目的]分析2种果蝇(Drosophila melanogaster与D.sechellia)线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因的密码子偏好性.[方法]利用GodonW1.4计算密码子偏好性参数的相关参数.[结果]2种果蝇线粒体中蛋白编码基因的AT含量比GC含量更高.D.sechellia的线粒体基因组的密码子偏好性比黑腹果蝇D.melanogastera的线粒体基因组的密码子偏好性略强.2种果蝇线粒体基因组中各蛋白编码基因CDs中,RSCU值大于1的密码子都是以A或U结尾,而并不以C或G结尾.2种果蝇线粒体基因组及NADH dehydrogenase subunit基因簇基因的密码子偏好性都可能受到突变压力影响.D.melanogaster线粒体基因组中不存在密码子CGC.NADH dehydrogenase subunit3基因的密码子偏好性可能比其他NADH dehydrogenase subunit基因更高.此外,尽管大部分NADH dehydrogenase subunit基因偏爱使用A或U结尾的密码子,但是在NADH dehydrogenase subunit6基因中,有2个AU结尾的密码子(AGA、GCA)的RSCU也为0.[结论]该研究结果为2种果蝇线粒体的进化研究提供了新观点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王鹏飞		6	3	1.0	1.0
2	王咏梅		44	93	5.0	6.0
3	吴新颖		17	42	4.0	5.0
4	蒋锡龙		23	65	5.0	7.0
5	高欢欢		18	30	4.0	4.0
6	苏玲		9	19	3.0	4.0
7	杨立英		14	34	4.0	5.0
8	任凤山		13	14	3.0	3.0