‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析

• 作者: 全绍文 周丽 徐航 杨洁萍 牛建新 马丽
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: ‘库尔勒香梨’ miR159家族 进化特性 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1-10
• 页数: 10页
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20180260

摘要

[目的]了解‘库尔勒香梨’miR159家族成员的进化特征及其在萼片脱落与宿存中的作用.[方法]以‘库尔勒香梨’Small RNA高通量测序中获得的miR159家族前体序列和成熟体序列为基础进行系统发育树构建、前体和成熟体的序列比对、前体二级结构预测、WebLogo保守性分析、靶基因预测和表达量分析.[结果]‘库尔勒香梨’miR159家族存在2个前体成员(psi-MIR159a、psi-MIR159c)和2个成熟体成员(psi-miR159a、psi-miR159c).2个前体成员的序列均能形成典型稳定的茎环结构,且序列完全一致,它们的最小折叠自由能(dG)都为-93.95 kal· mol-1.系统发育进化树显示,‘库尔勒香梨’和苹果MIR159家族亲缘关系很近.WebLogo分析表明,miR159家族成熟体的保守性很高,其保守序列为5’-UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUU-3’,但‘库尔勒香梨’的碱基保守性较低.靶基因预测显示,‘库尔勒香梨’miR159基因家族靶基因为转录因子bHLH91、BES1/BZR1同源蛋白4、热激70 ku蛋白质、Trihelix转录因子GT-1、G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1等.实时荧光定量PCR(qPCR)显示,‘库尔勒香梨’miR159家族的2个成员在初花期、盛花期和末花期3个时期萼片脱落组和宿存组的表达量有显著差异.[结论]‘库尔勒香梨’miR159家族在进化过程中既有保守性又有多样性,可能在萼片脱落过程中起作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	牛建新		74	762	17.0	23.0
2	马丽		12	154	6.0	12.0
3	杨洁萍		2	0	0.0	0.0
4	周丽		4	66	2.0	4.0
5	全绍文		5	1	1.0	1.0
6	徐航		1	0	0.0	0.0