山西谷子核心资源群体结构及主要农艺性状关联分析

• 作者: 乔治军 温琪汾 王海岗 穆志新
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 谷子 山西 地方品种 SSR 遗传多样性 连锁不平衡 关联分析
• 年，卷（期）: 2019,（22）
• 所属期刊栏目: 种质资源
• 页码范围: 4088-4099
• 页数: 12页
• 字数: 7107字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2019.22.013

摘要

[目的]分析山西谷子地方品种遗传多样性和群体遗传结构,筛选与谷子农艺性状相关联的分子标记,为谷子杂交组合亲本选配及分子标记辅助育种提供依据.[方法]利用96对SSR标记对595份山西谷子核心资源进行全基因组扫描,采用PowerMarker 3.25软件分析群体遗传多样性,利用STRUCTURE 2.3.4软件分析群体遗传结构,使用TASSEL 2.1软件中GLM (general linear model,Q)和MLM (mixed linear model,Q+K)2种方法,进行表型和标记关联分析.[结果] 96对SSR引物共扩增出828个等位变异,平均每对引物扩增到8.6个,变化范围为2-26;基因多样性指数变化范围为0.005-0.941,平均为0.610;多态信息量变化范围为0.005-0.938,平均为0.577;各位点杂合度变化范围为0-0.050,平均位点杂合度仅为0.016.群体结构分析将595份核心资源分为3个亚群.4 560个SSR位点成对组合中,共线性组合和非共线性组合之间都存在一定的连锁不平衡.D'统计概率(P＜0.01)支持的LD成对位点1 955个,占全部位点组合的42.9％,D'平均值为0.23.通过GLM方法共检测到12个极显著性位点(P＜0.01),表型变异解释率为2.34％-13.94％,平均为6.33％,贡献率较高的等位变异位点是CAAS2050(R2=13.94％)和B153(R2=11.36％);通过MLM方法共检测到9个极显著性位点(P＜0.01),表型变异解释率为2.80％-9.22％,平均为5.16％,贡献率较高的等位变异位点是P89(R2=9.22％)和P3*(R2=8.28％);2种方法共同检测到的极显著性位点有7个.[结论]利用SSR标记分析了595份山西谷子核心资源的遗传多样性和群体遗传结构.2种关联分析模型中,GLM方法关联到12个标记与节数、株高、颈长、茎粗、穗长、穗粗、码数、码粒数、蛋白质含量9个性状相关;MLM方法关联到9个标记与节数、颈长、叶宽、茎粗、穗粗、码数、码粒数、千粒重8个性状相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乔治军		33	291	9.0	16.0