结核分枝杆菌PPE32蛋白的生物信息学分析

• 作者: 付玉荣 伊正君 杨雨昕
• 来源期刊: 中国病原生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: PPE32蛋白 结核分枝杆菌 Rv1808 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 131-136
• 页数: 6页
• 分类号: R378.99
• 语种: 中文
• DOI: 10.13350/j.cjpb.190202

摘要

目的 应用生物学软件预测结核分枝杆菌PPE32基因编码蛋白的结构和功能. 方法 从NCBI中获得PPE32基因及其编码序列,通过ORF Finder、ProtParam、ProtScaleon Expasy、TMHMM Server v.2.0、SignalP 4.1 Server、TargetP 1.1 Server、NetPhos 3.1 Server、BLAST、SOPMA、SWISS-MODEL、ABCpred、SYFPEITHI、STRING等工具预测分析PPE32蛋白的相关生物学信息. 结果 Rv1808基因全长为1 230 bp,有8个开放阅读框架,其编码蛋白为PPE32,由409个氨基酸组成,等电点4.35,为亲水性蛋白,无跨膜区域及信号肽;有31个磷酸化位点,1个保守域;蛋白二级结构中α-螺旋占52.81％,β-折叠占8.31％,β-转角占5.62％,无规则卷曲占33.25％;有38个(得分＞0.5)B细胞抗原表位和12个(得分＞15)T细胞抗原表位. 讨论 PPE32蛋白为亲水性蛋白,具有潜在的T、B细胞抗原表位,可作为研发结核病疫苗的候选蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付玉荣		136	281	8.0	9.0
2	伊正君		135	257	8.0	8.0
3	杨雨昕		3	2	1.0	1.0