抗病毒治疗对HIV相关神经认知障碍病人脑组织基因表达谱的改变及生物信息学分析

• 作者: 刘启玲 孙娜 张荣强 李向文 范颂 郭亚收
• 来源期刊: 中国艾滋病性病
• 学科: 医学
• 关键词: 抗反转录病毒治疗 艾滋病病毒相关神经认知障碍 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 9-13
• 页数: 5页
• 分类号: R373.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.13419/j.cnki.aids.2019.01.03

摘要

目的 分析抗病毒治疗(ART)对艾滋病病毒(HIV)相关神经认知障碍病人脑组织基因表达谱的改变及关键蛋白作用,为临床预防、早期诊断及治疗提供一定的理论参考依据.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)基因芯片公共数据库中下载一组来自美国纽约的HIV相关神经认知障碍(HAND)病人治疗组(11人)、未治疗组(12人)和非病人(7人)尸检脑组织基因芯片数据,将数据导入分析软件GCBI、GenClip 2.0、NetworkAna-lyst、GATHER等,分析基因表达谱、蛋白-蛋白相互作用网络、分子生物学过程及基因功能,寻找ART病人的关键节点基因.结果 共发现242(0.44％)个差异表达基因,其中表达上调5个,下调237个.这些差异表达基因主要涉及神经元信号传递、突触传递、细胞信号传导等生物学功能,参与钙信号通路、Wnt信号通路、牛磺酸和牛磺酸代谢、谷氨酸代谢、MAPK信号通路,基因GSK3B和PAK1对于HAND治疗效果有一定预测能力,主要参与神经系统的调节作用.结论 242个差异表达基因能简单反映出ART对病人的治疗机制,差异表达基因主要参与神经元信号传递、突触传递、细胞信号传导等生物学功能,关键基因GSK3B、PAK1对HAND的治疗有一定的预测能力,并可能受到Wnt和MAPK信号通路的调节而发挥生物学功能.