大肠埃希菌CRISPRs间隔序列的来源研究

• 作者: 刘慧莹 崔聪聪 徐亚珂 杨海燕 梁文娟 段广才 郗园林 陈帅印
• 来源期刊: 中国病原生物学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 规律成簇的间隔短回文重复序列 间隔序列 噬菌体 质粒 大肠埃希菌
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 137-140
• 页数: 4页
• 分类号: R373
• 语种: 中文
• DOI: 10.13350/j.cjpb.190203

摘要

目的 研究大肠埃希菌全基因组中规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPRs)的间隔序列分布及来源规律.方法 通过BLAST、CRISPRs finder、ClustalX和CRISPRTarget分析CRISPR/Cas、间隔序列及其来源. 结果 203株大肠埃希菌中74.4％含有I-E CRISPR/Cas,9.4％含有I-F CRISPR/Cas,17.2％存在CRISPR3-4;CRISPR1,CRISPR2,CRISPR3和CRISPR4的间隔序列数目范围分别为1-25、1-27、4-7和2-22;其独特间隔序列数目分别为339、346、57和66.CRISPRTarget分析I-E和I-F CRISPR/Cas的间隔序列分别匹配816条质粒和293条噬菌体,2 428条质粒和139条噬菌体,差异有统计学意义(x2=319.30,P＜0.01). 结论 大肠埃希菌中CRISPR/Cas分布广泛,I-E和I-F CRISPR/Cas可能发挥不同的免疫功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段广才		174	980	15.0	21.0
2	杨海燕		54	247	9.0	13.0
3	郗园林		119	673	13.0	20.0
4	梁文娟		6	0	0.0	0.0
5	陈帅印		26	104	6.0	9.0
6	刘慧莹		6	1	1.0	1.0
7	徐亚珂		5	1	1.0	1.0
8	崔聪聪		2	11	1.0	2.0