栉孔扇贝高多态基因筛查及其表达特征分析

• 作者: 刘晶 刘雅然 包振民 夏雨 姚立杰 李亚娟 李语丽 杨志辉 王师
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 栉孔扇贝 单核苷酸多态性 高多态基因 适应性进化
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 41-48
• 页数: 8页
• 分类号: Q751
• 字数: 6015字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20180172

摘要

双壳贝类经历了几亿年的进化过程,在复杂多变的海洋环境中展现出了非凡的环境适应能力,而基因组的高多态性被认为与其环境适应性有关.本研究利用栉孔扇贝基因组重测序数据、早期发育及成体转录组数据分析了基因的多态性与表达特征.在栉孔扇贝基因组中共鉴定到了1 186个高多态基因,这些基因在染色体上呈现非均匀分布,并且在胚胎发育时期和成体组织中呈现出独特的表达特征.功能富集分析显示这些多态基因可能为扇贝胚胎发育的可塑性和成体的环境适应性提供了分子基础.研究还发现2个多拷贝基因——mucin和C1qDC具有显著的高多态性,可能在免疫系统防御和清除病原的过程中发挥了重要作用.本研究对高多态基因的表达特征和多态性进行了联合分析,为解析扇贝适应性进化的分子机制提供了线索.