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二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
作者:
吕仲贤
徐红星
杨亚军
王国荣
田俊策
郑许松
鲁艳辉
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
二化螟
内参基因
荧光定量PCR
基因表达
摘要:
[目的]筛选特定试验条件下二化螟(Chilo suppressalis)稳定表达的内参基因,为二化螟基因表达研究奠定基础.[方法]根据二化螟转录组测序结果挑选出11个候选基因,利用实时荧光定量PCR测定其在二化螟不同发育历期、不同组织、温度处理、杀虫剂处理、取食不同饲料、取食不同水稻、dsRNA处理和混合样品的表达量,利用RefFinder、BestKeeper、GeNorm和NormFinder等软件和ΔCt值对11个候选基因的稳定性进行评估.[结果]5种分析方法表明,在二化螟不同发育历期稳定性较高的内参基因是AK、RPL10和EF1,不同组织中稳定性较高的内参基因是EF1、TUB和ACTB,不同温度下较稳定的内参基因为TUB、RPL10和EF1,杀虫剂处理样品中较稳定的是TF4和ACTA,取食不同饲料较稳定的是TUB、TF4、EF1和RPL10,取食不同品种水稻较稳定的是TUB和EF1,dsRNA处理样品中较稳定的是TUB、AK、ACTB和EF1,混合样品中较稳定的是EF1、TUB和ACTB.[结论]为不同试验条件下选择合适的内参基因提供了参考,也有利于在二化螟基因表达研究中获得更加可靠准确的数据.
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文献信息
篇名
二化螟实时荧光定量PCR内参基因筛选和表达稳定性评价
来源期刊
中国水稻科学
学科
农学
关键词
二化螟
内参基因
荧光定量PCR
基因表达
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
实验技术
研究方向
页码范围
75-84
页数
10页
分类号
Q755|S435.112+.1
字数
6471字
语种
中文
DOI
10.16819/j.1001-7216.2019.8035
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传播情况
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
二化螟
内参基因
荧光定量PCR
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国水稻科学
主办单位:
中国水稻研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-7216
CN:
33-1146/S
开本:
大16开
出版地:
杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
邮发代号:
32-94
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
2058
总下载数(次)
1
总被引数(次)
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