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基于qPCR和LAMP技术的马铃薯晚疫病菌快速检测方法
基于qPCR和LAMP技术的马铃薯晚疫病菌快速检测方法
作者:
唐唯
张佩
林桐司骐
梁静思
王伟伟
祝菊澧
苏瑞
谢欣娱
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
定量PCR(qPCR)
环介导等温扩增(LAMP)
马铃薯晚疫病菌
潜伏侵染
检测
摘要:
马铃薯晚疫病菌(Phytophthora infestans)能侵染多种茄科植物,它引起的马铃薯晚疫病,是马铃薯生产中的第一大病害.为了开发能在田间快速检测马铃薯晚疫病痛原的方法,利用P.infestans T30-4基因组测序数据的contig 1.18131,设计qPCR和LAMP引物,优化扩增条件后得到引物的特异性和灵敏度,最后通过检测田间收获薯块,比较形态学传统方法、qPCR及LAMP的差异.特异性检测结果发现,qPCR和LAMP仅在含有P.infestans DNA模板的体系有阳性扩增,在寄主和其他微生物DNA中均无扩增;在优化的条件下,qPCR和LAMP的检测下限可达1×10-6ng/μL,在有寄主和其他微生物DNA存在的条件下,引物的灵敏度没有显著差异.利用两种快速方法对在大理、丽江及昆明3个地区田间收获薯块上检测发现,qPCR和LAMP方法得到的检出率差异极为不显著(P=0.420),两种快速检测方法和形态学鉴定方法检出率差异极显著(P=0.009).在大理、丽江及昆明3个地区的薯块中,两种分子检测方法检出率均比形态学方法高.其中,qPCR检测方法比形态学方法分别提高了12.00%、2.00%、8.70%;LAMP检测方法比形态学方法分别提高了11.30%、2.00%、8.70%.
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基于qPCR和LAMP技术的马铃薯晚疫病菌快速检测方法
来源期刊
作物杂志
学科
关键词
定量PCR(qPCR)
环介导等温扩增(LAMP)
马铃薯晚疫病菌
潜伏侵染
检测
年,卷(期)
2019,(6)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
168-176
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.16035/j.issn.1001-7283.2019.06.027
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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节点文献
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环介导等温扩增(LAMP)
马铃薯晚疫病菌
潜伏侵染
检测
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物杂志
主办单位:
中国作物学会
中国农科院作物科学研究所
出版周期:
双月刊
ISSN:
1001-7283
CN:
11-1808/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号中国农科院作物所内
邮发代号:
82-220
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
4407
总下载数(次)
4
总被引数(次)
36703
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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