枣食芽象甲线粒体基因组全序列测定与系统发育分析

• 作者: 张锋 李英梅 洪波 王远征 陈志杰
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鞘翅目 象甲科 枣食芽象甲 近缘种 线粒体基因组 蛋白质编码基因 系统发育
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 1305-1314
• 页数: 10页
• 分类号: Q969.94
• 字数: 6430字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.11.008

摘要

[目的]从线粒体基因组水平上探讨枣食芽象甲Scythropus yasumatsui与近缘种的系统发育关系.[方法]利用Illumina MiSeq测序平台对枣食芽象甲线粒体基因组进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析;利用贝叶斯法和最大似然法构建基于象甲科13个物种的线粒体基因组13个蛋白质编码基因核苷酸序列的系统发育树.[结果]结果表明,枣食芽象甲线粒体基因组全长为16 472 bp(GenBank登录号:MF807224),包含13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和2个非编码控制区,37个基因的排列顺序与祖先昆虫的线粒体基因排列顺序一致.13个蛋白质编码基因的起始密码子为ATN,其中除了cob和nad1基因的完全终止密码子为TAG外,其余11个基因的完全终止密码子为TA(A).22个tRNA基因中除了trnS1缺少DHU臂,反密码子由GCT变为TCT外,其余均能形成典型的三叶草结构.基于13个蛋白质编码基因序列构建的系统发育树结果显示,象甲科8个亚科系统发育关系为:(((隐喙象亚科(Cryptorhynchinae)+(象虫亚科(Curculioninae)+魔喙象亚科(Molytinae)))+长小蠹亚科(Platypodinae))+(粗喙象亚科(Entiminae)+Cyclominae亚科))+隐颏象亚科(Dryophthorinae)+小蠹亚科(Scolytinae)).[结论]在13种象甲科昆虫物种中,同属于粗喙象亚科的枣食芽象甲与南美果树象甲Naupactus xanthographus在系统发育树中聚为同一分支,表明基于线粒体基因组全序列的分子系统发育结果与传统的形态分类结果是一致的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	洪波		15	25	3.0	4.0
3	张锋		22	41	5.0	6.0
5	李英梅		37	33	4.0	4.0
7	陈志杰		29	44	5.0	6.0
9	王远征		6	8	2.0	2.0