茶树果胶乙酰酯酶家族成员的鉴定和生物信息学分析

• 作者: 冯琳 刘艳丽 曹丹 金孝芳 马林龙 龚自明
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 果胶乙酰酯酶 鉴定 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 521-529
• 页数: 9页
• 分类号: S571.1|S154.1
• 字数: 5786字
• 语种: 中文

摘要

茶树是氟的超富集植物,叶片高氟含量与人体健康密切相关.果胶乙酰酯酶(PAE)可能通过调控果胶的去乙酰化作用参与茶树叶片对氟的富集和解毒,然而目前并无茶树PAEs的相关报道.本研究以茶树舒茶早基因组和三代测序数据为基础,利用生物信息学的方法开展了PAEs的鉴定及其特性、进化和定位分析.结果表明,在茶树中,PAE 家族有 12 个蛋白,属于 PAE5、PAE8、PAE9、PAE10、PAE12 等 5 个成员,具有CLDG、PxYH、GGGWC、GS、NWN、rYCDG、GCSAG、NaAYDSWQ、HCQ等9个保守基序;在进化关系上,茶树PAEs与葡萄、可可亲缘关系较近;12个CsPAEs氨基酸大小为326~515,分子量为36.7~56.9 kDa,等电点为5.1~8.9;除CsPAE5、CsPAE5-1定位线粒体,CsPAE10-1可能定位胞质外,其他9个CsPAEs定位细胞壁;CsPAE5、CsPAE5-1、CsPAE12和CsPAE12-1为跨膜蛋白.此研究结果将为解析PAE在茶树叶片氟富集和解毒过程中的功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚自明	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	78	286	9.0	12.0
2	金孝芳	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	40	134	6.0	9.0
3	刘艳丽	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	17	44	4.0	5.0
4	曹丹	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	22	51	4.0	5.0
5	马林龙	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	21	46	4.0	5.0
6	冯琳	湖北省农业科学院果树茶叶研究所	2	0	0.0	0.0