一株阴环炭团菌(香灰菌)转化子形态变异的成因

• 作者: 吴小平 宋燕娇 明瑞光 杨立志 林隆基 江玉姬 邓优锦
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 基因敲除 菌株特异SNP位点 非靶标点突变 Illumina测序
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 2183-2194
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.190307

摘要

遗传转化方法是基因功能研究的重要方法之一,但在转化过程常出现转化子变异的现象,影响目标基因功能的判断.本文以阴环炭团菌菌落形态特征异常的拟基因TJAS01-V10012900敲除菌株12900-5为研究对象,通过PCR手段验证基因敲除的真实性,基因组重测序分析各转化子在基因敲除区域以及基因组其他区域的差异,转录组测序比较12900-5与其他转化子在基因表达层面的差异.比较基因组发现,12900-5与12900-6菌株在潮霉素抗性基因插入位置与片段一致,且不存在多拷贝现象.12900-5菌株有两个特异SNP位于不同的基因,一个与细胞周期S期有关,另一个与囊泡转运有关,两者均与菌丝生长有关.由此推测,转化子12900-5形态特征异常很有可能与这两个非靶标位点突变有关.转录组分析结果发现12900-5菌株在氨基酸代谢通路、翻译过程等多个代谢与信号途径基因的表达量明显下降.本研究例证了转化过程存在的非靶标变异现象,但导致这种变异的原因仍需进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴小平	福建农林大学菌物研究中心	63	486	13.0	19.0
2	江玉姬	福建农林大学食品科学学院	68	515	13.0	20.0
3	明瑞光	福建农林大学基因组与生物技术研究中心	4	0	0.0	0.0
4	邓优锦	福建农林大学菌物研究中心	44	315	12.0	16.0
5	杨立志	福建农林大学食品科学学院	4	6	1.0	2.0
6	林隆基	福建农林大学菌物研究中心	2	0	0.0	0.0
7	宋燕娇	福建农林大学菌物研究中心	4	4	1.0	2.0