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巴氏蘑菇子实体不同发育阶段的转录组分析
巴氏蘑菇子实体不同发育阶段的转录组分析
作者:
卢园萍
廖剑华
蔡志欣
郭仲杰
陈美元
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
巴氏蘑菇
生长发育
子实体
转录组
摘要:
为探讨巴氏蘑菇子实体不同发育阶段基因的表达情况,本研究对巴氏蘑菇子实体不同发育时期(原基、采收期和开伞期)进行转录组测序,以本实验室已获得的巴氏蘑菇JA菌株的不育单孢菌株JA-15036基因组为参考基因组研究原基与采收期及开伞期样本间差异表达基因,并对差异表达基因进行了GO功能和Pathway富集分析.GO功能分析结果显示,差异表达基因主要富集在跨膜转运、碳水化合物代谢途径和膜组分,它们协同调控为子实体生长发育提供稳定的内环境.KEGG富集分析结果表明,原基期上调的差异表达基因主要富集在核糖体蛋白和DNA复制,表明原基期细胞代谢旺盛,其中核糖体蛋白基因上调为后期蛋白质合成提供重要场所;采收期和开伞期子实体时期差异表达基因主要富集在碳水化合物代谢、脂肪酸降解和氨基酸代谢等途径,为巴氏蘑菇子实体的生长发育与成熟提供营养与能量.
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篇名
巴氏蘑菇子实体不同发育阶段的转录组分析
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
巴氏蘑菇
生长发育
子实体
转录组
年,卷(期)
2019,(12)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
2161-2173
页数
13页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.190267
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
郭仲杰
福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
19
74
6.0
7.0
2
陈美元
福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
23
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8.0
11.0
3
蔡志欣
福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
19
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5.0
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卢园萍
福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
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研究来源
研究分支
研究去脉
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菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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