基于AIM-InDels位点复合扩增体系检测乌鲁木齐蒙古族祖先信息

• 作者: 兰琼 刘艳芳 方雅婷 朱波峰 梅书燕 沈春梅 解通 邰发道
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 遗传学,群体 遗传结构 祖先信息标记 插入/缺失 蒙古族 乌鲁木齐
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 人体表征分子鉴识专题
• 页码范围: 545-552
• 页数: 8页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 5710字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2019.05.007

摘要

目的 基于课题组前期构建的用于祖先信息推断的39个AIM-InDels位点复合扩增检测体系,探索乌鲁木齐地区蒙古族的遗传背景和遗传结构. 方法 采集乌鲁木齐市蒙古族145名健康无关个体血样进行基因分型,以千人基因组计划数据库中三个洲际(东亚、欧洲和非洲)的17个群体作为参考人群,研究乌鲁木齐蒙古族的祖先信息构成.应用多种群体遗传学和生物信息学分析方法,进行配对群体间的Fst值与DA值比较分析、PCA分析、系统发育树的构建.应用Strucutre等软件分析乌鲁木齐蒙古族的祖先信息成分比例.结果 乌鲁木齐蒙古族在不同洲际群体的祖先信息成分占比为89:7:3(东亚:欧洲:非洲).相对于其他洲际群体,乌鲁木齐蒙古族与东亚群体有较小的Fst值与DA值,PCA分析中其与东亚群体形成聚类,系统发育树中亦与东亚群体在同一个分支.结论 乌鲁木齐蒙古族与东亚人群有着较近的遗传关系,其东亚祖先成分比例约为89％.