基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用

• 作者: 刘崇怀 姜建福 张颖 李民 樊秀彩
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄白腐病 microRNA 抗病 测序
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 143-152
• 页数: 10页
• 分类号: S663.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20180165

摘要

[目的]在前期的种质资源评价过程中,发掘一株中国野生刺葡萄0943,该株系高抗葡萄白腐病.基于microRNA (miRNA)在植物抗病中的重要作用,拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制.[方法]以抗病的中国野生刺葡萄为试材,对比感病的欧亚种‘美人指’,分别以病原菌诱导,在0 hpi(hours post inoculation)和病菌诱导后的12 hpi、36 hpi处理后采样,进行二代测序,并对数据进行KEGG及表达量的差异分析.[结果]对比感病葡萄‘美人指’,分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异,结合miRNA的表达量,获得了150个表达量发生变化的miRNA,其中44个miRNA的表达在刺葡萄和‘美人指’之间存在差异.5个miRNA在刺葡萄中特异表达,但是在‘美人指’中不表达,实施定量验证了这一结果.靶基因预测显示,其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子,还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因.[结论]筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA(miR 172a、miR172b、miR845a、novel 81和miR159a),可作为刺葡萄抗白腐病研究的目标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张颖	中国农业科学院郑州果树研究所	110	1023	18.0	28.0
2	樊秀彩	中国农业科学院郑州果树研究所	117	841	16.0	24.0
3	刘崇怀	中国农业科学院郑州果树研究所	177	1714	22.0	35.0
4	李民	中国农业科学院郑州果树研究所	52	253	8.0	14.0
5	姜建福	中国农业科学院郑州果树研究所	75	483	12.0	19.0