凡纳滨对虾E75基因可变剪切形式的鉴定与分析

• 作者: 张小溪 张晓军 李富花 杜江丽 相建海 袁剑波 高羿
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 E75基因 蜕皮 可变剪接 RNA干扰
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 771-781
• 页数: 11页
• 分类号: Q786|S917.4
• 字数: 6709字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20180111129

摘要

E75是对虾蜕皮激素信号通路的关键调控因子.为了深入了解E75基因的结构和功能,本实验从转录组数据中筛选得到注释为凡纳滨对虾E75基因的转录本,经与基因组序列比对分析,鉴定发现凡纳滨对虾E75基因至少存在6种可变剪接体,分别命名为LvE75-1、LvE75-2、LvE75-3、LvE75-4、LvE75-5和LvE75-6.其中LvE75-1/2/4/5/6均包含DBD和LBD结构域,与果蝇E75A/C有相同的结构域,而LvE75-3仅包含LBD结构域,与果蝇E75D相同.在凡纳滨对虾蜕皮过程中,LvE75-1/2/3/4在D3～D4时期高表达,而LvE75-5和LvE75-6表达量很低.在成体组织中,LvE75各种剪切形式在所有检测的组织中均有表达,且在表皮、肠和鳃中表达较高,在肝胰脏、血细胞和淋巴组织中仅LvE75-3表达较高.实验通过双链RNA干扰LvE75基因的表达,在干扰样品中,检测到Halloween基因中的spo、phm和dib表达下调,shd表达上调,表明LvE75可能通过调控Halloween基因的表达来影响蜕皮激素的合成;同时E75基因的干扰也使同为蜕皮激素早期应答基因的Br-C基因和Ftz-F1基因表达下调,HR3基因表达上调,表明LvE75基因对蜕皮信号通路上下游基因均有作用.在LvE75基因持续干扰12d后,凡纳滨对虾的蜕皮率显著低于对照组,而死亡率显著高于对照组,说明LvE75基因对凡纳滨对虾的蜕皮和生存具有重要作用.