IGF-1R基因SNPs检测及其与水貂生长性状的关联分析

• 作者: 丛波 刘宗岳 刘琳玲 宋兴超 宋姗姗 彭英华
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水貂 IGF-1R基因 单核苷酸多态性 生长性状 关联分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医
• 页码范围: 231-238
• 页数: 8页
• 分类号: S865.2|Q78
• 字数: 3892字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751337

摘要

为了研究胰岛素样生长因子1受体(IGF-1R)基因外显子2和外显子11的单核苷酸多态性,分析该基因变异与水貂生长性状的关联性,以红眼白水貂、金州黑水貂和咖啡水貂共计235个样本的血液基因组DNA为模板,采用PCR产物克隆和Sanger测序技术,筛查IGF-1R基因SNP位点,将差异位点与不同种群的水貂生长性状进行关联分析.结果表明,红眼白、金州黑水貂的外显子2和外显子11上检测到2个SNPs:c.207G>A和c.1782G>A;咖啡水貂在外显子2上检测到2个SNPs:c.207G>A和c.218T>A,在外显子11检测到1个SNPs:c.1782G>A.c.207G>A和c.1782G>A都属于无义突变.c.218T>A位点属于有义突变,氨基酸发生改变,脯氨酸变为精氨酸.关联分析表明:c.207G>A与金州黑水貂和咖啡水貂体长性状显著相关(P<0.05),其中GG基因型个体为水貂体长的优势基因型;c.1782G>A与咖啡水貂的体长和体质量显著相关(P<0.05),且与咖啡水貂的体质量呈现极显著差异(P<0.01),GA基因型作为咖啡水貂的优势基因型,其杂合GA基因型个体的体长、体质量都显著高于纯合GG基因型和纯合AA基因型个体.合并基因型进行关联分析发现:金州黑水貂合并基因型GGGA个体和GGAA个体的体长与GAGA个体体长差异极显著(P<0.01),基因型GGGA个体和GGAA个体的体长高于GAGA个体体长;金州黑水貂合并基因型GGGA个体体质量与GAGA个体差异显著(P<0.05),GGGA个体体质量高于GAGA基因型个体.试验可推断得出c.207G>A位点GG基因型是水貂体长的优势基因型;合并基因型GGGA和GGAA可能是影响金州黑水貂体长体质量的有利基因型,认为IGF-1R基因可能是影响水貂生长性状的候选基因.