AGPS基因沉默对神经胶质瘤细胞lncRNA、mRNA表达谱的影响及意义

• 作者: 岳伟 崔菀真 朱彧
• 来源期刊: 山东医药
• 学科: 医学
• 关键词: 神经胶质瘤 AGPS基因 长链非编码RNA 生物信息学 血管内皮生长因子
• 年，卷（期）: 2019,（35）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 6-11
• 页数: 6页
• 分类号: R739.41
• 字数: 5137字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-266X.2019.35.002

摘要

目的 观察沉默烷基甘油酮磷酸合酶(AGPS)表达对神经胶质瘤细胞长链非编码RNA (lncRNA)及其共表达mRNA表达谱的影响,并预测其生物学功能.方法 将神经胶质瘤U251细胞分为shR-AGPS-1组、shR-AGPS-2组和对照组,分别转染shR-AGPS-1、shR-AGPS-2和阴性对照慢病毒,筛选单克隆细胞后观察细胞形态.采用Western blotting法检测AGPS表达,基因芯片技术检测lncRNA及其共表达mRNA的差异表达谱,对lncRNA共表达mRNA进行基因本体(GO)及京都基因与基因组大百科全书(KEGG)通路富集分析,构建信号通路作用网络、全局信号转导网络、lncRNA对通路的调控网络.结果 与对照组比较,shR-AGPS-1组和shR-AGPS-2组细胞均出现团缩以及增殖抑制等变化,且shR-AGPS-2组变化更加显著.shR-AGPS-1组、shR-AGPS-2组细胞AGPS蛋白相对表达量均低于对照组,且shR-AGPS-2组降低更明显(P均＜0.05).与对照组比较,shR-AGPS-1组有73个lncRNA表达上调、107个lncRNA表达下调、13个mRNA表达上调、63个mRNA表达下调,shR-AGPS-2组266个lncRNA表达上调、233个lncRNA表达下调、61个mRNA表达上调、111个mRNA表达下调.GO富集分析显示共表达的mRNA主要参与细胞对缺氧的反应等生物学过程,KEGG富集分析显示晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体信号通路的富集度最高.信号通路作用网络和全局信号转导网络中连线较多的节点为磷脂酰肌醇三激酶(PI3K)信号通路、Toll样受体信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等.incRNA对通路的调控网络中lncRNAAK093732处于网络调控的枢纽地位,细胞因子及其受体相互作用为差异lncRNA调控的核心通路.结论 沉默AGPS表达可通过引起神经胶质瘤细胞中相关lncRNA及其共表达mRNA的差异表达而影响细胞增殖和凋亡,其中PI3K、Toll样受体及VEGF信号通路可能是其主要靶点通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱彧	天津市环湖医院天津市脑血管与神经变性重点实验室	7	17	3.0	3.0
2	岳伟	天津市环湖医院天津市脑血管与神经变性重点实验室	34	211	8.0	13.0
3	崔菀真		2	2	1.0	1.0