枸杞子治疗视网膜色素变性分子机制的网络药理学研究

• 作者: 刘晓清 周亚莎 宋厚盼 彭俊 彭清华 曾梅艳 杨毅敬 田野 蔡雄 陈小娟 陈新怡
• 来源期刊: 数字中医药（英文）
• 关键词: 枸杞子 网络药理学 视网膜色素变性 分子机制 靶点 信号通路
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 页码范围: 136-146
• 页数: 11页
• 字数: 1115字
• 语种: 中文
• DOI: 10.1016/j.dcmed.2019.12.002

摘要

目的 采用网络药理学和生物信息学方法探究枸杞子治疗视网膜色素变性(RP)的分子网络调控机制.方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索枸杞子可能的入血活性成分和作用靶点;通过疾病综合数据库检索与RP相关的基因靶点;采用STRING构建枸杞子成分靶点和RP疾病靶点的蛋白质-蛋白质交互作用(PPI)网络,并提取这两个网络的交集;运用DAVID对交集网络进行基因本体和KEGG通路分析;采用cytoHubba分析筛选关键靶点.结果 在TCMSP数据库共检索出与枸杞子相关的化学成分188个,根据药代动力学参数OB和DL筛得活性成分45个,进一步筛选获得36个入血活性成分,这些成分可能作用于201个基因靶点;从疾病综合数据库获得与RP直接相关的靶基因206个;将成分靶点PPI网络和疾病靶点PPI网络提取交集,得到89个枸杞子治疗RP可能作用的候选基因;这些基因主要涉及细胞内信号转导、GTP酶细胞活性调控、细胞形态调控等生物学过程,分子功能主要涉及Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子活性、GTP酶激活剂活性、受体信号蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性等,富集于细胞质、细胞膜、高尔基体等区域,主要与细胞周期相关通路、神经营养素信号通路、Ras信号通路有关;进一步分析筛选得到枸杞子治疗RP的10个关键性基因靶点.结论 枸杞子发挥药效作用的物质基础为环阿屯醇、十八碳-6,9-二烯酸乙酯等36个入血活性成分,其治疗RP的关键靶点包括RHO、PAK等10个基因,主要作用机制与调控Ras信号通路、神经营养素信号通路、细胞周期相关通路等信号网络有关.