白蛾周氏啮小蜂气味结合蛋白CcOBP3的生物信息学分析

• 作者: 张新玥 李敏 杨艺新 潘丽娜 相伟芳 郭美琪
• 来源期刊: 天津师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 白蛾周氏啮小蜂 气味结合蛋白 同源建模 分子对接 美国白蛾
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 45-49
• 页数: 5页
• 分类号: Q966
• 字数: 2795字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19638/j.issn1671-1114.20190209

摘要

为了探究白蛾周氏啮小蜂气味结合蛋白CcOBP3的结合特性,利用Bio Edit、SignalP3.0 Serve、HMMTop对CcOBP3的碱基序列进行了预测分析,用Swiss-Model对CcOBP3蛋白进行同源建模,从Pubchem下载美国白蛾的5种蛹挥发物(邻苯二甲酸二甲酯、正戊醛、十六烷、正十五烷、正十四烷)及3种植物挥发物(苊、3-蒈烯和丁酸丁酯)的结构,利用maestro 10.2软件进行分子对接.对CcOBP3碱基序列的分析结果表明,CcOBP3具有昆虫气味结合蛋白的典型特征,即相对分子质量小,有6个保守的半胱氨酸位点,在N端有信号肽.通过Swiss-Model构建的CcOBP3的结构模型中有Arg32-Thr51 (α1)、Leu54-Asn63 (α2)、Pro69-Leu81(α3)、Ala93-Ile102 (α4)、Ile108-Val116 (α5)、Pro128-Glu142 (α6)6个α螺旋结构,拉氏构象和PROSA能量评价结果均表明模型构象合理.分子对接结果表明,CcOBP3与3-蒈烯的结合特性最好,与美国白蛾的挥发物邻苯二甲酸二甲酯和正戊醛的结合特性也较好.推测CcOBP3的功能可能与引诱作用相关.CcOBP3与3-蒈烯主要通过范德华力、碳磷键、碳碳键等进行结合.