抽筒竹叶绿体基因组的密码子偏好性分析

• 作者: 国春策 张文根 李江平 杨光耀 秦政
• 来源期刊: 竹子学报
• 关键词: 抽筒竹 密码子偏好性 叶绿体基因组 最优密码子
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 79-87
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6567.2019.02.013

摘要

以抽筒竹叶绿体全基因组序列为材料进行了密码子偏好性分析,结果表明:1)抽筒竹叶绿体基因组密码子偏性较弱,有效密码子数(Effective number of codon,ENC)在38.85～61之间,平均值为49.66;2)密码子第1和第3位的GC含量一定程度上有相似性,GC1和GC2、GC3呈显著相关,而第2位GC含量和其它两位差异较大;3)密码子偏爱以A或U结尾,RSCU值大于1.00的密码子31个,其中16个第3位碱基为U、11个以A结尾、1个以G结尾;4)GC12与GC3相关性较弱,回归系数为0.35763;5)密码子偏好性更多受到选择的影响,代表基因多数落在标准曲线的下方.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨光耀	江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室	74	1170	21.0	32.0
2	张文根	江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室	9	10	2.0	3.0
3	国春策	江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室	2	0	0.0	0.0
4	李江平	江西农业大学江西省竹子种质资源与利用重点实验室	1	0	0.0	0.0
5	秦政		1	0	0.0	0.0