差异表达miRNA 在胰腺癌预后判断中的价值

• 作者: 张晓 高杰 魏超
• 来源期刊: 癌变·畸变·突变
• 学科: 医学
• 关键词: 胰腺癌 miRNA 预后 基因芯片表达汇编数据库 肿瘤基因组图谱数据库
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 173-179
• 页数: 7页
• 分类号: R318.04
• 字数: 4492字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-616x.2019.03.001

摘要

目的:分析胰腺癌组织和正常组织差异表达的miRNA,筛选与胰腺癌预后相关的生物标志.方法:下载并整理基因芯片表达汇编数据库(GEO)中GSE32678和GSE71533芯片数据集原始数据,应用R语言筛选差异表达miRNA,结合GSE24279数据集,获得差异表达的miRNA并取交集.应用生物信息学分析工具对交集miRNA进行靶基因预测,进而对靶基因进行功能分析,构建蛋白互作网络(PPI)、miRNA-mRNA调控网络、miRNA-mRNA-pathway调控网络,结合肿瘤基因组图谱数据库(TCGA)中胰腺癌样本的miRNA表达及预后数据,筛选出胰腺癌预后相关标志物.结果:共筛选出胰腺癌组织和正常组织22个交集miRNA,其中hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375与胰腺癌患者的生存预后密切相关.hsa-miR-125b-5p、hsa-miR-221-3p、hsa-miR-31-5p、hsa-miR-222-3p、hsa-miR-10a-5p是miRNA-mRNA调控网络中的核心miRNA.结论:通过对GEO和TCGA数据库胰腺癌相关数据的分析发现hsa-miR-30a-5p、hsa-miR-551a、hsa-miR-375显著影响胰腺癌患者的预后,可以作为判断预后的标志.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓	东南大学公共卫生学院	128	1028	18.0	26.0
2	魏超	东南大学公共卫生学院	7	6	2.0	2.0
3	高杰	东南大学公共卫生学院	6	15	2.0	3.0