二芳基乙烯衍生物与DNA结合的分子动力学研究

• 作者: PATRICK Norman 孙浩帆 张凌怡 张维冰
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 分子动力学模拟 手性药物 二芳基乙烯衍生物 DNA 旋转异构体 结合模式
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 物理化学
• 页码范围: 1229-1235
• 页数: 7页
• 分类号: O641.3
• 字数: 4985字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20180837

摘要

基于分子动力学方法,对2种旋转异构的二芳基乙烯(DTE,dithienylethene)衍生物(DTE1和DTE2)与不同分子结构DNA结合过程的热力学与动力学特征进行模拟,结果发现,DTE1,DTE2与DNA分子采用小凹槽结合(MiGB)的模式结合时所需能量最低,存在的分子间库仑能与范德华相互作用能最小,说明该结合模式最稳定;由于空间位阻作用,互为旋转异构体的2个DTE衍生物与DNA作用表现出截然不同的结合行为,DNA对DTE衍生物具有明显的对映异构体选择性;DTE衍生物与DNA分子作用位点的选择性直接与构成位点的碱基对相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张维冰	华东理工大学上海市功能材料化学重点实验室	64	332	9.0	16.0
2	张凌怡	华东理工大学上海市功能材料化学重点实验室	26	134	6.0	11.0