枣TCP家族基因鉴定及其表达分析

• 作者: 李景刚 薛超玲 赵一彤 赵锦 魏戏梦
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 枣 TCP转录因子 鉴定 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 39-45
• 页数: 7页
• 分类号: S665.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2019.0098

摘要

为了揭示枣TCP基因家族在枣生长发育中的作用,本文利用枣全基因组数据库搜索TCP家族基因,对该类基因进行鉴定、染色体分布等生物信息学和表达分析.结果 表明,枣TCP基因家族包含22个成员,蛋白长度范围为172～590个氨基酸,等电点为4.88～5.25,全部为亲水蛋白;其中15个基因分布在6条染色体上,5号染色体最多,有4个;聚类分析发现,该类基因可分为Class I和ClassⅡ2类,ClassⅡ又分为CYC/TB1和CIN亚类;组织特异性表达分析表明,该类基因主要在叶、蕾、花和果中表达;同时,植原体侵染对该类基因的表达有显著影响.蛋白互作预测发现ZjTCP和其他蛋白以及同一家族蛋白内部之间均可以发生互作.本研究结果为进一步研究该类基因的功能提供了重要线索和依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵锦	河北农业大学生命科学学院	80	1277	21.0	32.0
2	赵一彤	河北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
3	魏戏梦	河北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
4	薛超玲	河北农业大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	李景刚		1	0	0.0	0.0