小叶章PPDK基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 伍一宁 倪红伟 冷海楠 张玉 徐明怡 王丽媛 许楠
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 生物学
• 关键词: PPDK 小叶章 RT-PCR 系统进化树 ProtParam
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 140-146,187
• 页数: 8页
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文

摘要

[目的]获得小叶章PPDK的cDNA序列, 推测蛋白氨基酸理化性质及二三级结构等, 以及已知物种PPDK氨基酸系统进化分析.[方法]利用RT-PCR技术扩增PPDK序列, 通过ProtParam、Blast、THMHMM、SOPMA等生物信息软件分析序列.[结果]获得了小叶章PPDK的c DNA序列, 长1 035 bp, 相对分子量41. 910 kDa, 等电点为9. 70, 氨基酸中含量最高的是丝氨酸, 72个;蛋白二级结构中无规卷曲占48. 83％, 不含信号肽和跨膜结构, 氨基酸系统进化树结果分析发现小叶章PPDK与二穗短柄草、水稻亲缘关系最近.[结论]小叶章PPDK含有385个氨基酸, 含1个PDRP活性调控位点, 72个参与信号传导的磷酸化位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪红伟		113	949	16.0	27.0
2	许楠		17	57	6.0	6.0
3	张玉		37	117	6.0	10.0
4	冷海楠		9	31	3.0	5.0
5	王丽媛		13	45	4.0	6.0
6	徐明怡		8	48	4.0	6.0
7	伍一宁		11	35	4.0	5.0