缢蛏α-淀粉酶基因外显子区域SNPs筛选及其与生长性状关联性

• 作者: 孟德龙 李家乐 李浩 沈和定 牛东红 薛宝宝
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 α-淀粉酶基因 SNPs 双倍型 生长
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 214-223
• 页数: 10页
• 分类号: S913.4
• 字数: 6092字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13233/j.cnki.mar.fish.2019.02.010

摘要

α-淀粉酶是广泛存在于生物体内的消化酶,主要参与生物体内碳水化合物的代谢,为生物体提供维持生命、生长发育和繁殖所需的能量.为研究α-淀粉酶基因外显子与缢蛏(Sinonovacula constricta)生长性状的相关性,实验采用PCR产物直接测序法对其进行筛选比对,共获得18个候选SNPs位点,分别为:Rs-1:48 G/C、Rs-2:247 C/A、Rs-3:420 A/G、Rs-4:441C/T、Rs-5:537 G/T、Rs-6:837 G/T、Rs-7:936 A/G、Rs-8:952A/C、Rs-9:1047 T/G、Rs-10:1062 C/T、Rs-11:1287C/T、Rs-12:1350 A/C、Rs-13:1362 C/T、Rs-14:1371 C/T、Rs-15:1503T/C、Rs-16:1536 T/C、Rs-17:1737T/C、Rs-18:1788 C/T.随机选取同批繁殖、同塘养殖的缢蛏快长新品种"申浙1号"群体,运用MassARRAY质谱检测方法进行SNPs位点的分型,结果显示:除Rs-13位点外,其余位点均处于Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05),Hardy-Weinberg平均值为0.581;多态信息含量平均值为0.237.基因型与生长性状的关联性分析结果表明:Rs-5:537 G/T与Rs-10:1062 C/T位点基因型个体之间部分性状存在显著性差异(P＜0.05).13个位点组成的双倍型与生长性状的关联性分析显示:双倍型S6的壳高高于S3、S5、S7(P＜0.05),S6的总重大于S7(P＜0.05);另外,S6各个生长性状值在所有双倍型中最高.获得的缢蛏α-淀粉酶编码区外显子与生长性状相关的SNPs标记,可为缢蛏遗传改良特征标记筛选及定制培育提供有益参考.