β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响

• 作者: 张帅 曲永利 李伟 殷术鑫 王璐 辛小月
• 来源期刊: 中国草食动物科学
• 学科: 农学
• 关键词: 犊牛 抗奶 瘤胃菌群 差异表达基因 抗性基因
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 疾病防控
• 页码范围: 39-46
• 页数: 8页
• 分类号: S823.2
• 字数: 5142字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2019.01.009

摘要

为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液,构建犊牛瘤胃细菌宏基因组文库,并使用illumina MiSeq测序后通过NOG、KEGG和CAZy数据库进行生物信息学分析和功能注释.结果显示:①9个样品在eggNOG数据库中比对共有86145条基因得到了相应的功能注释;CAZy数据库在9个功能类共获得33980条注释;在KEGG通路注释得到1905条.②T1-T2、T1-T3、B1-B2和B1-B3四组分别含有318、1398、30和24个差异表达基因(DEGs).T1-T2组和T1-T3组DEGs在细胞周期及氨基酸生物合成代谢途径中明显富集,其中细胞周期代谢主要的DEGs为糖原合酶激酶-3β基因(Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β);周期蛋白依赖性激酶2基因(Cyclin-dependent kinase 2,CDK2)和周期蛋白依赖性激酶7基因(Cyclin-dependent kinase 7,CDK7).③试验共检测到6类抗生素抗性基因,共19种基因型.进一步分析抗生素耐药性产生机制,其中由外排泵(Efflux pump)引起的所占比例最大.说明牦牛随日龄的增加瘤胃菌群丰度提高,瘤胃菌群中的差异表达基因GSK-3β、CDK2和CDK7可能影响犊牛早期生长的乳脂代谢.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李伟	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	19	103	5.0	10.0
2	曲永利	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	73	453	13.0	18.0
3	辛小月	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	7	3	1.0	1.0
4	王璐	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	21	76	3.0	8.0
5	殷术鑫	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	11	6	2.0	2.0
6	张帅	黑龙江八一农垦大学动物科技学院	11	6	2.0	2.0