大豆籽粒不同发育时期的转录组分析

• 作者: 徐媛 李惠敏 李璐璐 秦新民 陈玉梅 陈锦玲
• 来源期刊: 大豆科学
• 关键词: 大豆 差异表达基因 油脂合成 转录组测序
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 533-541
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2019.04.0533

摘要

为了从分子水平上研究大豆籽粒不同发育时期的油脂合成与累积机理,对大豆开花20 d(DD_20)、30 d(DD_30)、40 d(DD_40)、50 d(DD _50)的籽粒进行了转录组测序.通过对转录组测序数据的分析,共得到原始数据461 566 988条,经过滤获得开花后20,30,40和50 d的clean reads,分别为107 548 920,111 670 776,109 339 672和108 884 270条.DD_20/DD_30、DD_30/DD_40、DD_40/DD_50比较组中的差异表达基因分别为4 759,6 245和13 763个,其中上调基因分别为1 801,2 941和5 695个.差异表达基因的KEGG pathway分析中,分别得到134,133和136条代谢通路,筛选到8个与油脂合成相关的差异表达基因,ACC、FATB、GPAT、DGATI、G3 PDH、KASI、SAD和FAD2.研究结果对深入研究大豆籽粒脂质合成的调控机理及大豆高油育种具有重要参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦新民	广西师范大学生命科学学院	74	526	13.0	17.0
2	李惠敏	广西师范大学生命科学学院	35	250	10.0	15.0
3	徐媛	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
4	陈玉梅	广西师范大学生命科学学院	9	10	1.0	3.0
5	陈锦玲	广西师范大学生命科学学院	5	3	1.0	1.0
6	李璐璐	广西师范大学生命科学学院	9	3	1.0	1.0