一株新型杀鲑气单胞菌烈性类T4噬菌体Asfd-1的分离鉴定和生物学特性分析

• 作者: 严庭玮 周燕 袁盛建 马迎飞
• 来源期刊: 集成技术
• 学科: 生物学
• 关键词: Asfd-1噬菌体 杀鲑气单胞菌 噬菌体治疗 生物信息
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 生物医药与生物医学工程
• 页码范围: 10-18
• 页数: 9页
• 分类号: Q93-331
• 字数: 4855字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12146/j.issn.2095-3135.20190305001

摘要

噬菌体是自然界中最普遍的生物之一,其专一性裂解细菌的能力在针对耐药菌感染治疗方面具有很大的应用前景.杀鲑气单胞菌(Aeromonas salmonicide)是水产养殖业中一种主要病原菌,其引发的疖疮病是一种常见的水产养殖动物疾病,具有高死亡率和高发病率,一旦爆发,将给水产养殖业带来重大的经济损失.该研究以杀鲑气单胞菌 MF663675.1 为宿主菌,从深圳海鲜市场的污水中,采用双层琼脂平板法分离纯化得到单个噬菌体,通过电镜对其表观形态特征进行观察,并运用生物信息的方法进一步确定其基因型特征及遗传分类地位.研究结果表明,分离出的烈性噬菌体命名为Asfd-1,噬菌斑呈圆形,轮廓分明、透明,直径约 1 mm.电镜观察显示,Asfd-1 具有对称的二十面体头部,以及长度为 51 nm 的收缩尾部.基因组测序和基因对比分析表明,Asfd-1 含双链脱氧核糖核酸(dsDNA),全基因组大小为 168 962 bp,鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比例为 41.53%,共编码 263个开放阅读框和 16 个转移核糖核酸(tRNA)序列,Genbank 登录号为 MK577502.根据国际病毒分类委员会规定的病毒分类方法,与同源的 Aeromonas phage 31 GCA_000862645.1 和 Aeromonas phiSA4 GCA_002710125.1 全基因组对比结果显示,Asfd-1 是新型噬菌体.综合电镜观察结果及系统进化树分析,Asfd-1 属于肌尾科下的 T4 噬菌体属、肌尾噬菌体科、有尾噬菌体目的新成员.该研究可为应用噬菌体治疗细菌感染提供进一步的参考.

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1	严庭玮		1	0	0.0	0.0