基于ChinaPca全基因组数据和基因表达量探讨LRP1对前列腺癌发病的影响

• 作者: 唐韦竹 张庆云 林睿 熊瀚 程继文 蒙清贵 陈阳
• 来源期刊: 中国癌症防治杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 前列腺癌 低密度蛋白受体相关蛋白1基因 单核苷酸多态性 ChinaPca 免疫组化
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 387-392
• 页数: 6页
• 分类号: R737.25
• 字数: 3552字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-5671.2019.05.05

摘要

目的 探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白-1(low density lipoprotein receptor-related protein-1,LRP1)基因对前列腺癌(prostate cancer,Pca)发病的影响.方法 在ChinaPca GWAS数据中对9个LRP1的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行前列腺癌易感性验证;取前列腺癌组织标本12例、癌旁正常组织18例和前列腺炎组织4例进行免疫组化检测;对TCGA和GTEx数据库的LRP1基因表达数据进行分析;在String网站构建LRP1基因的交互作用网络.结果 ChinaPca GWAS数据分析显示,LRP1基因的rs11172113位点可能是前列腺癌遗传易感位点(P=0.083),TC基因型与Pca发病风险有关(OR=1.267,95％CI:1.066～1.505,P=0.007).免疫组化检测和TCGA数据库分析结果显示,LRP1在前列腺癌组织和癌旁正常组织中的表达量差异无统计学意义(P>0.05),整合TCGA和GTEx数据库数据后LRP1在前列腺癌组织中的表达降低(P<0.05).交互作用网络显示,LRP1与前列腺癌通路相关基因PLAT、PDGFB、PDGFRB有关联.结论 LRP1基因rs11172113位点可能是前列腺癌的遗传易感位点.LRP1基因在前列腺癌组织中呈低表达,可能通过调节PLAT、PDGFB和PDGFRB基因表达调控前列腺癌相关通路而导致前列腺癌发病.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊瀚	530021 南宁 广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	0	0.0	0.0
5	林睿	南宁广西医科大学基因组与个体化医学研究中心	1	0	0.0	0.0
6	唐韦竹	530021 南宁 广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	0	0.0	0.0
10	蒙清贵	南宁广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	0	0.0	0.0
11	张庆云	南宁广西医科大学附属肿瘤医院泌尿外科	1	0	0.0	0.0
12	陈阳	南宁广西医科大学第一附属医院泌尿外科	1	0	0.0	0.0