草莓KEA家族基因的克隆、鉴定及表达分析

• 作者: 姜玉素 宋志忠 李珍 王庆莲 赵密珍
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 K+/H+逆向转运体 生物信息学分析 基因克隆与表达
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 391-399
• 页数: 9页
• 分类号: S668.4
• 字数: 5745字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2019.02.021

摘要

K+/H+逆向转运体(KEA)介导细胞中K+和H+的动态平衡,在维持植物体内的离子平衡、生长发育和信号转导中起重要作用,然而,相关研究主要体现在模式作物拟南芥中,果树中KEA家族基因的功能依然未知.本研究以Yellow Wonder 5AF8草莓为材料,筛选并克隆KEA家族基因,并对其进行生物信息学鉴定和表达特征分析,为研究果树K+/H+平衡及钾素动态平衡机制提供基因资源和理论依据.结果表明,在草莓基因组中检索并克隆到5个KEA家族基因,命名为FveKEA1～FveKEA5,属于典型的植物K+/H+逆向转运体基因;编码的蛋白质与7种已报道的不同科属植物的KEA家族蛋白在氨基酸水平上具有25.00％的一致性,并可分为2个亚族(Group I和Group II),其中,草莓FveKEA1和FveKEA2属于Group I,只含有4个Motif基序,而FveKEA3～FveKEA5属于Group II,含有7个Motif基序;系统进化树表明草莓FveKEA2和FveKEA4分别与葡萄VvKEA2和苹果MdoKEA6紧密聚在一起,草莓FveKEA1、FveKEA3和FveKEA5分别与葡萄VvKEA1、白杨PtrKEA4、桃PpeKEA4等相应成员在遗传距离上较近;草莓KEA家族蛋白主要定位于细胞质膜,均含有12～14个跨膜区,除FveKEA3外,均为稳定蛋白,且只有FveKEA5含有信号肽;转录表达谱分析结果揭示草莓KEA家族基因在多种组织或器官中均有表达,实时荧光定量PCR结果表明FveKEA1在5AF8草莓不同组织中的整体表达水平最高,在花瓣和未成熟果实中的表达量最为突出,其次是FveKEA4,而其他3个基因的整体表达水平相对较低.此外,在草莓KEA基因启动子区域鉴定到至少16种顺式作用元件,且均含有光感应、胚乳表达和脱落酸(ABA)响应的作用元件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵密珍	江苏省农业科学院果树研究所	123	1382	20.0	32.0
2	宋志忠	鲁东大学农学院	6	11	2.0	3.0
4	王庆莲	江苏省农业科学院果树研究所	13	56	5.0	7.0
5	姜玉素		3	1	1.0	1.0
9	李珍	鲁东大学农学院	1	1	1.0	1.0