金山区柯萨奇病毒A组6型基因特征分析

• 作者: 孙箐爽 宋灿磊 李淑华 王唐 臧昊 董兆鹏 蔡光
• 来源期刊: 预防医学
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A组6型 VP1基因 系统发育分析 同源性分析 抗原表位
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 疾病控制
• 页码范围: 1136-1139
• 页数: 4页
• 分类号: R373.23
• 字数: 2306字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19485/j.cnki.issn2096-5087.2019.11.014

摘要

目的 分析上海市金山区2017—2018年分离的柯萨奇病毒A组6型(CoxA6)VP1基因特征和氨基酸位点突变,为手足口病防控提供依据.方法 对金山区2017—2018年采集并分离到16株CoxA6分离株VP1全长基因进行扩增、测序、 序列比对,构建系统发生树,分析核苷酸和氨基酸同源性以及氨基酸位点突变.结果 金山区16株CoxA6分离株均属于E2亚型同一个进化分支,16株间VP1基因核苷酸同源性为92.3％～97.7％,氨基酸同源性为98.4％～100.0％.与金山区16株分离株同源性最高的是2018年山东分离株MK357081/CHN/SD/JN/2018,核苷酸和氨基酸同源性分别为95.7％～99.3％和98.7％～99.7％.13株CoxA6分离株VP1氨基酸序列存在氨基酸位点变异,涉及8个氨基酸变异位点,但在抗原表位重要位点201D、243H、245R、247Y、248M和249R均未检测到抗原漂移.结论 16株CoxA6分离株核苷酸和氨基酸序列高度同源且位于E2亚型同一进化分支;CoxA6 E2亚型可能是金山区2017—2018年流行的主导基因型,金山区CoxA6 VP1存在氨基酸突变位点但未涉及关键的抗原表位.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李淑华		10	28	3.0	4.0
2	王唐		4	6	2.0	2.0
3	宋灿磊		33	205	8.0	12.0
4	董兆鹏		3	1	1.0	1.0
5	孙箐爽		3	3	1.0	1.0
6	臧昊		3	6	1.0	2.0
7	蔡光		1	0	0.0	0.0