基于高通量测序筛选‘紫娟’花青素合成相关的miRNA

• 作者: 刘悦 夏丽飞 孙云南 田易萍 蒋会兵 陈亮 陈林波
• 来源期刊: 茶叶科学
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 花青素合成 高通量测序 miRNA 靶基因
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 页码范围: 681-691
• 页数: 11页
• 分类号: S571.1|Q52
• 字数: 4328字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-369X.2019.06.008

摘要

为筛选调控紫娟茶树花青素合成相关 miRNA,以茶树品种紫娟(ZJ)、云抗 10 号(YK)和福鼎大白茶(FD)为材料,构建了miRNA文库.鉴定出46种已知的miRNAs和67种新的miRNAs,预测到具有注释的靶基因 765个.通过差异表达分析,筛选出在 ZJ与 YK、ZJ与 FD共有差异表达的 miRNA 24个.通过对24个差异表达miRNA的靶基因分析,筛选出可能参与调控花青素合成的miRNA 4个,包括miR828a、miR845c、novel_14和 novel_87,其预测的靶基因包括转录因子基因 MYB4 、 MYB23、 MYB26、 MYB82、 bHLH74以及 4-香豆酰辅酶A链接酶( 4CL)、二氢黄酮醇4-还原酶( DFR)和UDP-葡萄糖黄酮3-O-葡糖基转移酶( UFGT)等基因.利用 RT-PCR 分析 8 个差异表达的 miRNA,其结果与转录组分析一致.本研究结果为进一步开展茶树花青素生物合成的调控机制研究奠定基础.