miR-23基因家族进化分析及其在猪睾丸组织中的表达变化

• 作者: 冉茂良 彭馥芝 罗荟 翁波 陈斌 高虎
• 来源期刊: 经济动物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 miR-23a/23b 进化 定量表达
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 36-43
• 页数: 8页
• 分类号: S828.2|Q786
• 语种: 中文
• DOI: 10.13326/j.jea.2018.1293

摘要

运用生物信息学方法在miRBase数据库检索到miR-23基因家族的序列,利用Ensembl数据库信息确定miR-23在基因组的位置,采用MEGA5.0构建miR-23系统进化树,再利用RT-qPCR技术定量检测其在沙子岭猪睾丸组织中7个不同发育时期(D1、D30、D60、D90、D120、D150、D180)的表达变化.结果表明:在37种物种中共搜索到82条序列,且各序列具有高度保守性,大部分位于基因间隔区.进化分析表明:各物种miR-23基因家族可能以不同的方式和速度进化而来.RT-qPCR检测结果显示,miR-23基因家族在猪睾丸组织中不同发育时期表现出相同趋势的表达规律,即出生后其表达水平有所降低,到性成熟期又呈现升高趋势.本研究对miR-23基因家族进行系统进化分析并检测其在沙子岭猪睾丸组织中表达变化规律,为进一步探明miR-23基因家族的功能及作用机制奠定基础.