松材线虫Bx-ubc-3基因克隆及泛素通路鉴定

• 作者: 张瑞芝 李丹蕾 许佳瑶 陈俏丽
• 来源期刊: 森林工程
• 学科: 农学
• 关键词: 松材线虫 泛素结合酶3 E2 泛素途径
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 森林资源建设与保护
• 页码范围: 9-15
• 页数: 7页
• 分类号: S763.11
• 字数: 5421字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-8023.2019.05.002

摘要

泛素途径可以调节许多关键的细胞功能.为探究松材线虫中是否存在泛素途径以及泛素途径中的关键酶基因—泛素结合酶基因ubc3,构建松材线虫cDNA文库,并进行测序、ORF分析、同源性分析、系统发育树构建、蛋白相互作用预测和分子动力学模拟等工作.克隆到长度为957bp的Bx-ubc-3基因片段.随后的序列分析表明,其开放阅读框长度为738 bp,编码245个氨基酸;氨基6酸同源性分析结果表明,Bx-UBC-3与已知的泛素结合酶高度同源;蛋白互作和分子对接分析及分子动力学模拟结果表明,Bx-UBC-3的结合位点位于一个α螺旋、一个Loop1(L1)环与一个Loop2(L2)环;形成硫酯的Cys103位于L2上,构成催化裂隙;Bx-UBC-3和Bx-Rbx1之间以及Bx-UBC-3和Bx-泛素之间形成氢键.这些结果表明松材线虫中存在一条理论泛素通路,其中的关键酶Bx-UBC-3是开发高效抗线虫生物药剂的潜在靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李丹蕾	东北林业大学林学院	31	106	6.0	8.0
2	陈俏丽	东北林业大学林学院	26	83	6.0	7.0
3	张瑞芝	东北林业大学林学院	15	48	5.0	6.0
4	许佳瑶	东北林业大学林学院	3	1	1.0	1.0