梁山慈竹BABY BOOM基因的克隆与表达分析

• 作者: 唐一 曹颖 王丽丽 胡尚连 黄艳
• 来源期刊: 竹子学报
• 关键词: 梁山慈竹 BBM基因 克隆 生物信息学 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 24-31
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6567.2019.02.004

摘要

以梁山慈竹Dendrocalamus farinosus转录组数据库为基础,采用同源克隆技术从梁山慈竹笋中克隆到1个BABY BOOM(BBM)基因,命名为DfBBM,其开放阅读框长度为1101 bp,推测编码366个氨基酸残基.蛋白功能域预测分析表明,DfBBM基因含有AP2结构域,证明该基因确实属于AP2/ERF转录因子家族基因之一;进化树分析发现,DfBBM基因与玉米的BBM2以及山羊草和旱麦草的BBM基因在一个分支上,序列高度相似;保守结构域分析发现,DfBBM和ZmBBM2,AeBBM1,EtBBM之间含有8个保守基序,这可能有助于研究DfBBM和其他物种BBM基因的相似功能.DfBBM的三级结构预测和乙烯反应性转录因子ERF096模型高度相似.组织表达分析表明,DfBBM基因在梁山慈竹展开叶和笋尖表达较高,DfBBM基因对ABA、IAA、NAA和MeJA激素处理均有响应,其中ABA、IAA和MeJA激素处理2 h后其表达量上升达到最高值,随后开始下降;而在NAA激素处理后其表达则明显下降.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡尚连	西南科技大学植物细胞工程实验室	117	751	15.0	20.0
2	黄艳	西南科技大学植物细胞工程实验室	9	9	2.0	3.0
3	王丽丽	西南科技大学植物细胞工程实验室	3	0	0.0	0.0
4	唐一		1	0	0.0	0.0
5	曹颖		2	11	1.0	2.0