一种基于异构网络算法的药物-蛋白关联性研究方法

• 作者: 宋晖 徐婷 龚家瑜
• 来源期刊: 智能计算机与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 药物-蛋白关联性 重启随机游走 异构网络
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 学术研究与应用
• 页码范围: 47-49,52
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 2312字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-2163.2019.01.010

摘要

药物与蛋白质间关联性的研究,有助于药物的重新定位和发现药物新的使用途径,是网络药理学的重要研究内容.应用现有网络随机游走算法预测药物与蛋白质间新的关联时,一般直接在药物-蛋白质二分图网络内进行随机游走,并且不断重复此过程,这种方法效率很低,还会遗漏药物-药物相似性网络和蛋白-蛋白相似性网络中部分拓扑信息.鉴于此,本文提出一种异构网络异步重启随机游走算法(Drug Restart Walk Random Prediction,DRWRP),构建药物-蛋白质异构网络,深层次挖掘二者间潜在的关联性.该算法分别在药物相似性网络、蛋白质相似性网络以及药物-蛋白质二分图网络中进行随机游走,然后在网络间不停跳转,反复迭代后形成稳态概率向量,最终得到潜在最优关联.仿真实验表明,本文提出的算法可以有效预测药物与蛋白质间新的关联,多数预测结果获得了文献证据支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋晖	东华大学计算机科学与技术学院	18	65	4.0	7.0
2	徐婷	东华大学计算机科学与技术学院	3	1	1.0	1.0
3	龚家瑜	东华大学计算机科学与技术学院	1	1	1.0	1.0