文冠果果实转录组测序及分析

• 作者: 张凌云 赵阳阳 郭雨潇
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 文冠果 果实 转录组测序 SSR标记
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 24-31
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-1101

摘要

为了研究文冠果果实转录组中功能基因表达情况,采样RNA-seq技术对文冠果不同发育时期果实进行测序分析.结果显示:两个时期样品材料测序组装后共获得68298个Unigene序列,有24691个Unigene得到注释,占36.15％;GO数据库注释显示14766条Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程3大类54个功能组;KOG数据库中注释到的13994条Unigene功能系统分为25类;以KEGG代谢途径数据库为依据,可将8284个文冠果果实转录组Unigene分为127个代谢通路;在文冠果果实转录组中发现11732个SSR位点,其中最多的为单核苷酸SSR,占60.85％.本研究为文冠果果实分子生物学研究提供了一定的基础和参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张凌云	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	39	174	8.0	12.0
2	赵阳阳	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	2	1	1.0	1.0
3	郭雨潇	北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室	2	1	1.0	1.0