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热应激前后湖羊下丘脑差异表达新基因的筛选与注释
热应激前后湖羊下丘脑差异表达新基因的筛选与注释
作者:
仲跻峰
冯小品
孟春花
张俊
张莉
曹少先
李隐侠
王慧利
钱勇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
湖羊
热应激
下丘脑
转录组测序
real-timePCR
摘要:
湖羊是中国南方唯一的绵羊品种,耐湿热是其重要的特色性状之一.但目前关于其耐湿热机制尚不清楚.本研究以湖羊为研究对象,通过转录组测序技术鉴定热应激前后下丘脑组织中的新基因及其差异表达,并通过不同数据库比对和分析,进行新基因功能注释.结果表明,热应激前后在湖羊下丘脑组织中共检测到1990个新转录本,通过功能注释,发现1344个新基因.在热应激组和对照组湖羊中,差异表达新基因186个,其中130个新基因表达上调,56个新基因表达下调,通过比对发现这些基因分别与细胞免疫、繁殖、生长代谢及相关信号通路相关.Real-time PCR验证试验结果表明,10个热应激前后表达差异基因中有9个与转录组测序结果一致.这些结果为绵羊基因组的进一步完善及基因功能的挖掘提供了一定的数据基础,为全面解析绵羊热应激的分子机制提供更多的依据.
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文献信息
篇名
热应激前后湖羊下丘脑差异表达新基因的筛选与注释
来源期刊
江苏农业学报
学科
生物学
关键词
湖羊
热应激
下丘脑
转录组测序
real-timePCR
年,卷(期)
2019,(2)
所属期刊栏目
畜牧兽医·水产养殖
研究方向
页码范围
363-369
页数
7页
分类号
Q781
字数
4158字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-4440.2019.02.017
五维指标
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
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下丘脑
转录组测序
real-timePCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业学报
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-4440
CN:
32-1213/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号省农科院内
邮发代号:
28-113
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
3989
总下载数(次)
8
总被引数(次)
36498
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