辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析

• 作者: 丁锦平 刘冬梅 徐园园 朱晓琴 洪权春 王亚月 裴冬丽 陈姝彤 陈文超 韩霜
• 来源期刊: 辣椒杂志
• 关键词: 辣椒素 pAMT 基因家族 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 字数: 3613字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-4542.2019.03.001

摘要

为研究辣椒氨基转移酶(pAMT,putative aminotransferase)基因在辣椒基因组中的分布和功能,以尊辣1号基因组为参照,利用生物信息学方法对辣椒中pAMT基因家族成员进行全基因组水平分析.结果显示:辣椒基因组中存在9个pAMT基因家族成员,集中分布在8号和9号染色体上,氨基酸序列多重比对显示这9个蛋白分别聚类到3大分支上.结构分析表明,pAMT家族所有蛋白均含有5个保守结构域Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 8和Motif 9.基因表达分析结果显示:基因Capana09g000427在叶片中不表达,在果皮中表达量最高,其次是子房,在种子和胎座也有表达.基因Capana08g000160在种子、胎座中不表达,仅在叶片中表达稍高,在其他组织的表达量均较低.辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析为进一步研究辣椒氨基转移酶pAMT基因家族的功能提供了科学依据.